As infraestruturas do MARE contemplam laboratórios, estações marinhas e equipamentos. Todas as Unidades Regionais de Investigação do MARE proporcionam gabinetes, salas de aula, salas de reuniões, salas de videoconferência e laboratórios totalmente equipados, alguns com carácter multifuncional, enquanto outros são únicos, equipados com sistemas de alta tecnologia específicos.
As instalações do MARE tornam o centro uma referência internacional para a utilização e gestão de meios científicos e plataformas oceânicas.
