Sob a coordenação do Laboratório de Ciências do Mar da Universidade de Évora, são desenvolvidos desde 1997 estudos de monitorização de ambientes marinhos do Porto de Sines (água, sedimento subtidal, substrato duro intertidal e subtidal, e organismos indicadores) com os seguintes objetivos gerais: em cada ambiente considerado, analisar padrões de variação espacial e temporal, a diferentes escalas, de diversas variáveis biológicas e físico-químicas, e detetar eventuais níveis e/ou efeitos de contaminação por poluentes, aplicando e desenvolvendo técnicas e métodos adequados; constituir uma extensa base de dados sobre a qualidade de ambientes marinhos do Porto de Sines; implementar, de forma interativa, a monitorização da qualidade dos ambientes marinhos do Porto de Sines, contribuindo para a gestão e o controlo ambiental deste porto; avaliar, a longo prazo, os impactes das atividades industriais existentes, e os decorrentes de eventuais derrames acidentais ou outros acidentes ambientais. Permitindo identificar eventuais problemas de contaminação antropogénica e sugerir intervenções para a sua correção, atenuação e prevenção, e fornecendo suporte científico para a tomada de decisões por parte da respetiva Autoridade Portuária, estes estudos de monitorização podem contribuir de forma importante para a gestão e o controlo ambiental do Porto de Sines.