Estuda os ecossistemas de água doce, comunidades e funcionamento e o efeito das alterações globais nos rios à escala local e global. Tem desenvolvido métodos para a avaliação ecológica dos rios. Tem estado envolvida nas várias fases de implementação da Directiva Quadro da Água em Portugal e países Mediterrânicos. Investiga os ecossistemas aquáticos urbanos e a sua biodiversidade, a sua reabilitação, e a sua importância para a sustentabilidade das cidades e saúde humana.