Interpretação e descrição da biodiversidade estuarina e marinha através da taxonomia integrativa, combinando a taxonomia tradicional com técnicas moleculares. Estudos filogenéticos/filogeográficos e genética de populações incluindo a utilização de marcadores genéticos (p. ex. DNA barcodes) e de recursos bioinformáticos. Tenho focado o meu trabalho principalmente em macroorganismos bentónicos e aplicado novas tecnologias (p. ex. Next-Generation Sequencing).