Desenvolve o seu trabalho de investigação nos domínios da biologia e ecologia de peixes (espécies diádromas, dulciaquícolas, estuarinas e costeiras), biotelemetria aquática, gestão e conservação, dinâmica de populações ictíicas e monitorização ecológica.
Participou em mais de 30 projetos científicos e consultadorias, tendo coordenado vários projetos dedicados ao estudo de peixes anádromos. Publicou 94 artigos em revistas de circulação internacional, 4 livros e 13 capítulos de livros.